Introduzione alla diagnosi di laboratorio della malattia infettiva

I test di laboratorio possono identificare i microrganismi in modo diretto (p. es., visivamente, usando un microscopio, facendo crescere il microrganismo in coltura) o indiretto (p. es., identificando gli anticorpi diretti contro il microrganismo). I tipi generali di test comprendono

• Microscopia

• Coltura

• Test immunologici (test di agglutinazione come agglutinazione su lattice, test immunoenzimatici, Western blot, test di precipitazione e test di fissazione del complemento)

• Metodi genotipici di identificazione basati sugli acidi nucleici o test di amplificazione degli acidi nucleici (p. es., reazione a catena della polimerasi [PCR])

• Metodi di identificazione fenotipici non basati sugli acidi nucleici (p. es., test sierologici, spettrometria di massa [MALDI-TOF MS], spettrometria a risonanza magnetica nucleare [NMR])

In linea di massima la coltura è lo standard di riferimento per l'identificazione dei microrganismi, tuttavia in alcuni casi i risultati possono essere disponibili solo dopo giorni o settimane, e non tutti i patogeni possono essere coltivati in tali casi risulta dunque utile il ricorso a test alternativi. A seguito dell'identificazione del patogeno mediante esame colturale, il laboratorio può anche valutare la sua sensibilità agli antibiotici. L'introduzione di test diagnostici rapidi sia genotipici che fenotipici ha permesso un approccio più rapido e mirato alla terapia antimicrobica. Talvolta metodi molecolari possono essere utilizzati per rilevare specifici geni di resistenza.

Alcuni test (p. es., colorazione di Gram, esame colturale di routine per microrganismi a metabolismo aerobico) possono permettere di identificare una grande varietà di patogeni e vengono richiesti routinariamente in molte patologie di sospetta origine infettiva. Tuttavia, poiché alcuni patogeni non vengono identificati mediante l'utilizzo di questi test, il medico deve essere consapevole dei limiti di ciascuna prova per ogni patogeno sospettato. In questi casi, i medici devono richiedere test specifici per il patogeno sospettato (p. es., colorazioni o mezzi di coltura speciali) o informare il laboratorio del microrganismo o degli organismi sospettati in modo che possano essere selezionati i test più specifici (1).