Введение в лабораторную диагностику инфекционных заболеваний

Лабораторные анализы могут идентифицировать микроорганизмы прямым методом (например, визуально при микроскопии, путем выращивания культур микроорганизмов) или непрямым методом (например, идентифицируя антитела к возбудителю). Основные виды анализов:

• Микроскопия

• Бактериологический посев

• Иммунологические тесты (тесты на агглютинацию, такие как реакция латекс-агглютинации, иммуноферментный анализ, Вестерн-блоттинг, реакция преципитации и реакция связывания комплемента)

• Генотипические методы идентификации на основе нуклеиновых кислот или NAAT (например, полимеразная цепная реакция [ПЦР])

• Фенотипические методы идентификации, не основанные на нуклеиновых кислотах (например, серологические анализы, масс-спектрометрия [MALDI-TOF MS], спектрометрия ядерного магнитного резонанса [ЯМР])

Обычно тест-культура – это золотой стандарт для идентификации микроорганизмов, но результаты могут быть недоступны в течение многих дней или недель; кроме того, болезнетворные микроорганизмы могут быть выделены в культуре, что делает полезными альтернативные тесты. После культивирования и последующей идентификации возбудителя, в условиях лаборатории возможно также оценить его чувствительность к антибактериальным препаратам. Внедрение генотипических и фенотипических экспресс-диагностических тестов (RDT) позволило использовать более быстрый и целенаправленный подход к антимикробной терапии. Иногда для определения специфических генов устойчивости могут быть использованы молекулярные методы.

Некоторые тесты (например, окрашивание по Граму, обычная аэробная культура) могут обнаружить большое разнообразие болезнетворных микроорганизмов. В то же время некоторые возбудители могут быть не выявлены в анализах; поэтому клиницисты должны знать об ограничениях каждого теста для конкретных микроорганизмов. В таких случаях врачи должны запрашивать тесты, специфичные для предполагаемого патогена (например, специальные окраски или культуральные среды), или информировать лабораторию о подозреваемом организме или организмах, чтобы можно было выбрать более специфические тесты (1).