感染症の臨床検査診断に関する序論

執筆者：Maria T. Vazquez-Pertejo, MD, FACP, Wellington Regional Medical Center;

Larry M. Bush, MD, FACP, Charles E. Schmidt College of Medicine, Florida Atlantic University

Reviewed ByBrenda L. Tesini, MD, University of Rochester School of Medicine and Dentistry

レビュー/改訂修正済み 2025年 1月

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臨床検査では，微生物を直接的（例，肉眼観察，顕微鏡の使用，培養での微生物の増殖）または間接的（例，微生物に対する抗体の同定）に同定できる可能性がある。一般的な検査の種類としては以下のものがある：

顕微鏡検査
培養
免疫学的検査（ラテックス凝集法などの凝集試験，酵素免疫測定，ウェスタンブロット，沈降試験，補体結合試験）
遺伝子型レベルの核酸検出法による同定手法またはNAAT（例，PCR検査）
表現型レベルの核酸検出法によらない同定手法（例，血清学的検査，質量分析法［MALDI-TOF MS］，核磁気共鳴［NMR］分光法）

通常は培養が微生物同定のゴールドスタンダードであるが，結果が判明するまでに数日ないし数週間を要し，また全ての病原体を培養できるとは限らないため，代替試験が有用となる。病原体を培養して同定すれば，抗微生物薬に対する感受性も検査室で評価できるようになる。遺伝子型ベースと表現型ベースの両面で迅速診断検査（RDT）が導入されたことで，抗微生物薬による治療への迅速で的を絞ったアプローチが可能となっている。ときに分子生物学的方法を用いて，具体的な耐性遺伝子を検出することも可能である。

一部の検査（例，グラム染色，ルーチンの好気培養）は，広範囲の病原体を検出できるため，感染症が疑われる様々な状況でよく施行される。しかしながら，それらの検査では見逃される病原体もあるため，臨床医は疑われる病原体に対する個々の検査法の限界を認識しておかなければならない。そのような場合，臨床医は疑われる病原体に対する特異的検査（例，特殊な染色法または培地）を要請するか，検査室がより特異的な検査法を選択できるように疑われる微生物を助言すべきである(1)。

表＆コラム

主な病原細菌に対する診断検査

表＆コラム

主な病原細菌に対する診断検査

主な病原細菌に対する診断検査
微生物	顕微鏡検査	培養	NAAT	抗原の検出	抗体の検出
Anaplasma属	✓		✓		✓
炭疽菌（Bacillus anthracis）	✓	✓	✓
Bartonella属	✓		✓		✓
百日咳菌（Bordetella pertussis）		✓	✓		✓
Borrelia属		✓*	✓*		✓
Brucella属	✓	✓	✓		✓
Chlamydia属			✓		✓
ボツリヌス菌（Clostridium botulinum）	✓	✓		✓
Clostridioides difficile		✓	✓	✓
破傷風菌（Clostridium tetani）	✓	✓
ジフテリア菌（Corynebacterium diphtheriae）		✓
Coxiella属			✓		✓
Erysipelothrix属	✓	✓
野兎病菌（Francisella tularensis）		✓			✓
Haemophilus ducreyi	✓	✓
Helicobacter pylori	✓	✓*		✓
Kingella属	✓*	✓	✓
Klebsiella属	✓		✓
Legionella属		✓	✓	✓	✓
Leptospira属		✓*	✓		✓
Listeria属	✓	✓	✓
Mycoplasma属			✓		✓
Neisseria属	✓	✓	✓
Nocardia属	✓	✓	✓
Rhodococcus equi	✓	✓
Rickettsia属			✓		✓
レンサ球菌属	✓	✓	✓	✓
梅毒トレポネーマ（Treponema pallidum）	✓		✓		✓
Tropheryma whipplei	✓		✓
Vibrio属		✓	✓
ペスト菌（Yersinia pestis）	✓	✓	✓	✓
* 臨床で広く用いられていない検査。
NAAT = 核酸増幅検査。
Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

* 臨床で広く用いられていない検査。

NAAT = 核酸増幅検査。

Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

表＆コラム

病原性抗酸菌に対する診断検査

病原性抗酸菌に対する診断検査
微生物	顕微鏡検査	培養	NAAT	抗体の検出
非結核性	✓	✓	✓*
結核菌およびMycobacterium ulcerans	✓	✓	✓
らい菌（Mycobacterium leprae）	✓		✓	✓
* 臨床で広く用いられていない検査。
NAAT = 核酸増幅検査。
Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

* 臨床で広く用いられていない検査。

NAAT = 核酸増幅検査。

Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

表＆コラム

主な病原真菌に対する診断検査

主な病原真菌に対する診断検査
微生物	顕微鏡検査	培養	NAAT	抗原の検出	抗体の検出
Aspergillus属	✓	✓	✓	✓
Blastomyces属	✓	✓	✓	✓	✓
Candida属	✓	✓	✓
Coccidioides属	✓	✓	✓	✓	✓
Cryptococcus neoformans	✓	✓	✓	✓
皮膚糸状菌	✓	✓
Histoplasma capsulatum	✓	✓	✓	✓	✓
Malassezia属	✓	✓
Mucorales属	✓	✓	✓
Pneumocystis jirovecii	✓		✓	✓
Sporothrix属	✓	✓			✓
NAAT = 核酸増幅検査。
Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

NAAT = 核酸増幅検査。

Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

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主な病原ウイルスに対する診断検査

主な病原ウイルスに対する診断検査
微生物	顕微鏡検査	培養	NAAT	抗原の検出	抗体の検出
アデノウイルス	✓*	✓	✓
BKウイルス	✓		✓
COVID-19（SARS-CoV2）			✓		✓
サイトメガロウイルス（CMV）	✓	✓	✓		✓
エンテロウイルス		✓	✓		✓
エプスタイン-バーウイルス（EBV）			✓		✓
A型，B型，C型，D型，E型肝炎			✓	✓	✓
単純ヘルペスウイルス	✓	✓	✓		✓
ヒトヘルペスウイルス6型			✓		✓
ヒト免疫不全ウイルス（HIV）			✓	✓	✓
ヒトパピローマウイルス（HPV）	✓		✓
インフルエンザ			✓	✓
JCウイルス			✓		✓
ラクロスウイルス			✓		✓
リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス（LCMV）			✓		✓
麻疹			✓		✓
エムポックス（サル痘）	✓		✓
流行性耳下腺炎（ムンプス）			✓		✓
ノロウイルス			✓		✓
パラインフルエンザ		✓	✓
パルボウイルスB19			✓		✓
ポワッサンウイルス			✓		✓
狂犬病	✓		✓	✓	✓
RSウイルス（RSV）		✓	✓	✓
風疹					✓
セントルイス脳炎ウイルス			✓		✓
ダニ媒介性脳炎ウイルス					✓
水痘帯状疱疹	✓	✓	✓		✓
ウエストナイルウイルス			✓		✓
ジカウイルス			✓		✓
* 臨床で広く用いられていない検査。
NAAT = 核酸増幅検査。
Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

* 臨床で広く用いられていない検査。

NAAT = 核酸増幅検査。

Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

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主な原虫性および寄生虫性病原体に対する診断検査

主な原虫性および寄生虫性病原体に対する診断検査
微生物	顕微鏡検査	培養	NAAT	抗原の検出	抗体の検出
Babesia属	✓		✓		✓
Cryptosporidium属	✓		✓	✓
Cyclospora属	✓		✓
Entamoeba属	✓		✓	✓	✓
Enterobius vermicularis	✓
Giardia属	✓		✓	✓
腸管寄生線虫	✓			✓	✓
Leishmania属	✓	✓	✓		✓
Plasmodium属	✓		✓	✓
疥癬	✓
Taenia solium	✓				✓
Toxocara属	✓				✓
Trichinella spiralis	✓			✓	✓
Trypanosoma属	✓				✓
NAAT = 核酸増幅検査。
Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

NAAT = 核酸増幅検査。

Adapted from Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ: Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 9th Edition.Philadelphia, Elsevier, 2020.

参考文献

1.Miller JM, Binnicker MJ, Campbell S, et al.Guide to Utilization of the Microbiology Laboratory for Diagnosis of Infectious Diseases: 2024 Update by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and the American Society for Microbiology (ASM). Clin Infect Dis.Published online March 5, 2024.doi:10.1093/cid/ciae104

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