Vari agenti patogeni, batterici (shigellosi, infezione da Campylobacter, o infezione da Salmonella), virali (virus dell'epatite A, B, C) e parassitari (giardiasi o amebiasi), vengono trasmessi attraverso le pratiche sessuali, soprattutto quelle che comportano la contaminazione oro-fecale. In ordine decrescente di rischio, queste pratiche sono
Oral-retto
Anal-genitale
Oral-genitale
Rapporto genitale-genitale
Sebbene alcuni dei patogeni batterici e parassitari sopra menzionati possano causare proctite, essi solitamente causano un'infezione alta del tratto intestinale; i sintomi comprendono diarrea, febbre, sensazione di gonfiore, nausea e dolore addominale. Le infezioni multiple sono frequenti, soprattutto nelle persone che hanno molti partner sessuali e che hanno pratiche sessuali che portano a contatto orale-retto diretto o indiretto.
La maggior parte di questi agenti patogeni può causare infezioni senza sintomi; l'infezione asintomatica è la regola con Entamoeba dispar (precedentemente nota come Entamoeba histolytica non patogena), che si verifica comunemente negli uomini che hanno rapporti sessuali con uomini.
(Vedi anche Panoramica sulle infezioni a trasmissione sessuale.)