一般的な病原性細菌の分類

種類	細菌
偏性好気性
グラム陰性球菌	Moraxella catarrhalis，淋菌（Neisseria gonorrhoeae），髄膜炎菌（N. meningitidis）*
グラム陽性桿菌	Corynebacterium jeikeium
抗酸菌	Mycobacterium avium complex，M. kansasii，らい菌（M. leprae），結核菌（M. tuberculosis），Nocardia属
腸内細菌目（かつての腸内細菌科）以外のブドウ糖非発酵菌	Acinetobacter calcoaceticus，Elizabethkingia meningoseptica（かつてのFlavobacterium meningosepticum），緑膿菌，P. alcaligenes，その他のPseudomonas属細菌，Stenotrophomonas maltophilia*
選好性グラム陰性球桿菌および桿菌	Brucella属，Bordetella属，Francisella属，およびLegionella属
レプトスピラ（らせん菌）	Leptospira属
偏性嫌気性
グラム陰性桿菌	Bacteroides fragilis，その他のBacteroides属細菌，Fusobacterium属，Prevotella属
グラム陰性球菌	Veillonella属
グラム陽性球菌	Peptococcus niger，Peptostreptococcus属
無芽胞グラム陽性桿菌	Actinomyces属，Bifidobacterium属，Eubacterium属，およびCutibacterium（かつてのPropionibacterium）属
芽胞形成グラム陽性桿菌	ボツリヌス菌（Clostridium botulinum），ウェルシュ菌（C. perfringens），破傷風菌（C. tetani），その他のClostridium属細菌
通性嫌気性
グラム陽性球菌，カタラーゼ陽性	黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）（コアグラーゼ陽性），表皮ブドウ球菌（S. epidermidis）（コアグラーゼ陰性），その他のコアグラーゼ陰性ブドウ球菌q
グラム陽性球菌，カタラーゼ陰性	Enterococcus faecalis，E. faecium，Streptococcus agalactiae（B群レンサ球菌），S. bovis，肺炎球菌（S. pneumoniae），化膿レンサ球菌（S. pyogenes）（A群レンサ球菌），緑色レンサ球菌群（S. mutans，S. mitis，S. salivarius，S. sanguis），S. anginosus群（S. anginosus，S. milleri，S. constellatus），Gemella morbillorum
グラム陽性桿菌	炭疽菌（Bacillus anthracis），豚丹毒菌（Erysipelothrix rhusiopathiae），Gardnerella vaginalis（グラム不定性）
グラム陰性桿菌	腸内細菌目（Citrobacter属，Enterobacter 属，大腸菌［Escherichia coli］，Klebsiella属，モルガネラ菌［Morganella morganii］，Proteus属，Plesiomonas shigelloides，Providencia rettgeri，チフス菌［Salmonella typhi］，その他のSalmonella属細菌，セラチア菌［Serratia marcescens］，Shigella属，腸炎エルシニア［Yersinia enterocolitica］，ペスト菌［Y. pestis］）
腸内細菌目以外のブドウ糖発酵菌	Aeromonas hydrophila，Chromobacterium violaceum，Pasteurella multocida
選好性グラム陰性球桿菌および桿菌	Aggregatibacter （かつてのActinobacillus）actinomycetemcomitans，Eikenella corrodens，インフルエンザ菌（Haemophilus influenzae），その他のHaemophilus属細菌
マイコプラズマ	肺炎マイコプラズマ
微好気性
弯曲桿菌	Campylobacter jejuni，Helicobacter pylori，Vibrio cholerae，V. vulnificus
スピロヘータ（らせん菌）	Borrelia burgdorferi，梅毒トレポネーマ（Treponema pallidum）
偏性細胞内寄生性
クラミジア	Chlamydia trachomatis，Chlamydophila pneumoniae，C. psittaci
コクシエラ	Coxiella burnetii
リケッチア	発疹チフスリケッチア（Rickettsia prowazekii），R. rickettsii，発疹熱リケッチア（R. typhi），Orientia tsutsugamushi，Ehrlichia chaffeensis，Anaplasma phagocytophilum
* 通常は偏性好気性菌と考えられているが，これらの細菌は代替の電子受容体として亜硝酸を用いることにより，酸素がなくても増殖できる。

種類

細菌

偏性好気性

グラム陰性球菌

Moraxella catarrhalis，淋菌（Neisseria gonorrhoeae），髄膜炎菌（N. meningitidis）*

グラム陽性桿菌

Corynebacterium jeikeium

抗酸菌

Mycobacterium avium complex，M. kansasii，らい菌（M. leprae），結核菌（M. tuberculosis），Nocardia属

腸内細菌目（かつての腸内細菌科）以外のブドウ糖非発酵菌

Acinetobacter calcoaceticus，Elizabethkingia meningoseptica（かつてのFlavobacterium meningosepticum），緑膿菌*，P. alcaligenes，その他のPseudomonas属細菌，Stenotrophomonas maltophilia

選好性グラム陰性球桿菌および桿菌

Brucella属，Bordetella属，Francisella属，およびLegionella属

レプトスピラ（らせん菌）

Leptospira属

偏性嫌気性

グラム陰性桿菌

Bacteroides fragilis，その他のBacteroides属細菌，Fusobacterium属，Prevotella属

グラム陰性球菌

Veillonella属

グラム陽性球菌

Peptococcus niger，Peptostreptococcus属

無芽胞グラム陽性桿菌

Actinomyces属，Bifidobacterium属，Eubacterium属，およびCutibacterium（かつてのPropionibacterium）属

芽胞形成グラム陽性桿菌

ボツリヌス菌（Clostridium botulinum），ウェルシュ菌（C. perfringens），破傷風菌（C. tetani），その他のClostridium属細菌

通性嫌気性

グラム陽性球菌，カタラーゼ陽性

黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）（コアグラーゼ陽性），表皮ブドウ球菌（S. epidermidis）（コアグラーゼ陰性），その他のコアグラーゼ陰性ブドウ球菌q

グラム陽性球菌，カタラーゼ陰性

Enterococcus faecalis，E. faecium，Streptococcus agalactiae（B群レンサ球菌），S. bovis，肺炎球菌（S. pneumoniae），化膿レンサ球菌（S. pyogenes）（A群レンサ球菌），緑色レンサ球菌群（S. mutans，S. mitis，S. salivarius，S. sanguis），S. anginosus群（S. anginosus，S. milleri，S. constellatus），Gemella morbillorum

グラム陽性桿菌

炭疽菌（Bacillus anthracis），豚丹毒菌（Erysipelothrix rhusiopathiae），Gardnerella vaginalis（グラム不定性）

グラム陰性桿菌

腸内細菌目（Citrobacter属，Enterobacter 属，大腸菌［Escherichia coli］，Klebsiella属，モルガネラ菌［Morganella morganii］，Proteus属，Plesiomonas shigelloides，Providencia rettgeri，チフス菌［Salmonella typhi］，その他のSalmonella属細菌，セラチア菌［Serratia marcescens］，Shigella属，腸炎エルシニア［Yersinia enterocolitica］，ペスト菌［Y. pestis］）