Les infections urinaires peuvent être divisées en infections des voies supérieures et inférieures:
Les infections des voies supérieures impliquent les reins (pyélonéphrite).
Les infections des voies inférieures impliquent la vessie (cystite), l'urètre (urétrite) et la prostate (prostatite).
Cependant, dans la pratique, et en particulier chez l'enfant, la distinction entre les sites d'infection peut être difficile ou impossible. De plus, les infections peuvent se propager d'une région à l'autre de l'appareil urinaire. Bien que l'urétrite et la prostatite soient des infections qui impliquent les voies urinaires, le terme d'infection urinaire correspond généralement à la pyélonéphrite et à la cystite.
Les infections bactériennes des voies urinaires provoquent la plupart des cas de cystite et de pyélonéphrite. Les agents pathogènes non bactériens les plus fréquents sont les champignons (généralement des espèces de Candida) et, moins fréquemment, des mycobactéries, des virus et des parasites. Les pathogènes non bactériens affectent généralement les patients immunodéprimés; qui ont un diabète, une obstruction, ou des anomalies structurelles des voies urinaires; ou qui ont subi récemment une instrumentation des voies urinaires.
Les virus autres que les adénovirus (impliqués dans la cystite hémorragique) n'ont aucune contribution majeure aux infections urinaires chez le patient immunocompétent.
Les maladies parasitaires principales responsables d'infection urinaire sont la filariose, la trichomonase, leishmaniose, le paludisme et la schistosomiase (bilharziose). Parmi les maladies parasitaires mentionnées, seule la trichomonase est fréquente aux États-Unis, habituellement comme une infection sexuellement transmissible.
L'urétrite habituellement due à une infection sexuellement transmissible. La prostatite est habituellement causée par une bactérie et est parfois une infection sexuellement transmissible.
